地区报告
doi：10.18129/b9.bioc.RegionReport
该包适用于生物导体的3.12版；对于稳定的最新版本，请参阅地区报告。
生成一组基因组区域或DESEQ2/EDGER结果的HTML或PDF报告
生物导体版本：3.12
生成HTML或PDF报告，以探索一组区域，例如在Derfinder执行的基本对分辨率下对RNA-Seq数据的注释 - 敏捷表达分析的结果。您还可以为DESEQ2或EDGER结果创建报告。
作者：Leonardo Collado-Torres [AUT，CRE]
，Andrew E. Jaffe [aut]，Jeffrey T. Leek [Aut，THS]
维护者：leonardo collado-torres
引用（从r内，输入引用（“区域报告”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ reamizereport”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ RegineReport”）
| html | R脚本 | 使用Bumphunter结果的示例报告 |
| html | R脚本 | 区域报告简介 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 覆盖范围，，，，差异性，，，，差甲基化，，，，差异词，，，，免疫学，，，，QualityControl，，，，rnaseq，，，，报告写作，，，，测序，，，，软件，，，，转录，，，，可视化 |
| 版本 | 1.24.2 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.0（R-3.1）（6。5年） |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 依靠 | R（> = 3.2） |
| 进口 | 生物使用（> = 2.5.19），德芬德（> = 1.2.5），变形，，，，deseq2，，，，GenomeInfodB，，，，基因组机，，，，尼特（> = 1.6），Knitrbootstrap（> = 0.9.0），方法，Refmanager，，，，rmarkDown（> = 0.9.5），S4VECTORS，，，，总结性特征，UTILS |
| 链接 | |
| 建议 | 生物管理器，，，，Biovizbase，，，，Bumphunter（> = 1.7.6），derfinderplot（> = 1.3.2），SessionInfo，，，，DT，，，，EDGER，，，，GGBIO（> = 1.35.2），GGPLOT2， 网格，栅格，，，，iranges，，，，MGCV，，，，帕西拉，，，，pheatmap，，，，rcolorbrewer，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg19，，，，晶须 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/leekgroup/regionreport |
| BugReports | https://support.bioconductor.org/t/regionreport/ |
| 取决于我 | |
| 进口我 | recountworkflow |
| 建议我 | 叙事 |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | regionreport_1.24.2.tar.gz |
| Windows二进制 | RegionReport_1.24.2.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | RegionReport_1.24.2.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/regionreport |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：套餐/区域报告 |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/regionreport/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
