randRotation

DOI:10.18129 / B9.bioc.randRotation

这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅randRotation。

随机旋转与批处理高维数据结构的方法

Bioconductor版本:3.12

一组方法来执行随机旋转高维、正态分布的数据(如微阵列或RNA-seq数据)与批处理结构。随机旋转方法允许精确的测试相关的测试统计线性模型在任意批量效应校正方法。

作者:彼得Hettegger (aut (cre)

维护人员:彼得Hettegger < p。在gmail.com hettegger >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“randRotation”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“randRotation”)

PDF	R脚本	随机旋转方案介绍
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	BatchEffect,BiomedicalInformatics,DifferentialExpression,GeneExpression,遗传学,MicroRNAArray,微阵列,归一化,预处理,RNASeq,测序,软件,StatisticalMethod
版本	1.2.2
Bioconductor自	BioC 3.11 (r - 4.0)(1年)
许可证	GPL-3
取决于
进口	方法、图形跑龙套,统计数据,Rdpack(> = 0.7)
链接
建议	knitr,BiocParallel,lme4,nlme,rmarkdown,BiocStyle,testthat(> =魅惑,limma,股东价值分析
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/phettegger/randRotation
BugReports	https://github.com/phettegger/randRotation/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	randRotation_1.2.2.tar.gz
Windows二进制	randRotation_1.2.2.zip
macOS 10.13(高山脉)	randRotation_1.2.2.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/randRotation
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ randRotation
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/randRotation/
包下载报告	下载数据