rTRM

DOI:10.18129 / B9.bioc.rTRM

这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅rTRM。

转录监管模块从PPI网络的识别

Bioconductor版本:3.12

rTRM识别转录监管模块(trm)从蛋白质相互作用网络。

作者:迭戈Diez

维护人员:迭戈Diez < diego10ruiz gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“rTRM”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“rTRM”)

PDF	R脚本	介绍rTRM
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneRegulation,GraphAndNetwork,网络,软件,转录
版本	1.28.0
Bioconductor自	BioC 2.13 (r - 3.0)(7.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 2.10),igraph(> = 1.0)
进口	AnnotationDbi,DBI,RSQLite
链接
建议	RUnit,BiocGenerics,MotifDb,图,PWMEnrich,biomaRt,knitr,Biostrings,BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm8.masked,org.Hs.eg.db,org.Mm.eg.db,ggplot2
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/ddiez/rTRM
BugReports	https://github.com/ddiez/rTRM/issues
取决于我
进口我	rTRMui
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	rTRM_1.28.0.tar.gz
Windows二进制	rTRM_1.28.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	rTRM_1.28.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rTRM
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ rTRM
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/rTRM/
包下载报告	下载数据