rSWeeP

DOI:10.18129 / B9.bioc.rSWeeP

这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅rSWeeP。

函数来创建低维氨基酸序列出现的比较矩阵

Bioconductor版本:3.12

扫描方法被开发来支持氨基酸序列之间的分析和协助对齐免费的系统发育研究。这种方法是基于稀疏词的概念,应用于生物序列的扫描和血压的转换矩阵。针对低维矩阵的氨基酸序列的生成事件。

作者:Danrley r·费尔南德斯(aut com、cre)

维护人员:Danrley r·费尔南德斯< DanrleyRF gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“rSWeeP”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“rSWeeP”)

HTML	R脚本	rSWeeP
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	对齐,遗传学,测序,软件,StatisticalMethod,SupportVectorMachine,技术
版本	1.2.0
Bioconductor自	BioC 3.11 (r - 4.0)(1年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 4.0)
进口	pracma,统计数据
链接
建议	Biostrings、方法、knitr,rmarkdown,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	rSWeeP_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	rSWeeP_1.2.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	rSWeeP_1.2.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rSWeeP
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ rSWeeP
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/rSWeeP/
包下载报告	下载数据