rGREAT

DOI:10.18129 / B9.bioc.rGREAT

这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅rGREAT。

客户端为伟大的分析

Bioconductor版本:3.12

这个包让伟大的(注释工具)的基因组区域富集分析自动通过构造一个HTTP POST请求根据用户的输入并自动检索结果伟大的web服务器。

作者:Zuguang顾

维护人员:Zuguang顾< z。顾在dkfz.de >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“rGREAT”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“rGREAT”)

HTML	R脚本	分析以极大的
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	报道,去,GeneSetEnrichment,GenomeAnnotation,通路,测序,软件,WholeGenome
版本	1.22.0
Bioconductor自	BioC 3.1 (r - 3.2)(6年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	R (> = 3.1.2),GenomicRanges,IRanges、方法
进口	rjson,GetoptLong(> = 0.0.9),RCurl跑龙套,统计数据
链接
建议	testthat(> = 0.3),knitr,circlize(> = 0.4.8),rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/jokergoo/rGREAThttp://great.stanford.edu/public/html/
取决于我
进口我	profileplyr
建议我	TADCompare
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	rGREAT_1.22.0.tar.gz
Windows二进制	rGREAT_1.22.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	rGREAT_1.22.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rGREAT
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ rGREAT
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/rGREAT/
包下载报告	下载数据