quantro

DOI:10.18129 / B9.bioc.quantro

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见quantro．

何时使用分位数归一化的测试

Bioconductor版本:3.12

使用原始数据(例如继承eset的对象)对分位数规范化假设进行数据驱动测试(例如ExpressionSet, MethylSet)。还必须提供关于每个样本的组级信息(例如肿瘤/正常状态)，因为测试评估用户定义的组之间的分布是否存在全局差异。

作者:斯蒂芬妮·希克斯[aut, cre]，拉斐尔·伊里扎里[au]

维护者:Stephanie Hicks

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("quantro")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“quantro”)

超文本标记语言	R脚本	quantro用户指南
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	微阵列，MultipleComparison，归一化，预处理，测序，软件
版本	1.24.0
在Bioconductor	BioC 3.0 (R-3.1)(6.5年)
许可证	GPL (> = 3)
取决于	R (>= 4.0)
进口	Biobase，minfi，doParallel，foreach，迭代器，ggplot2、方法、RColorBrewer
链接
建议	knitr，RUnit，BiocGenerics，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我	纱
建议我	qsmooth
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	quantro_1.24.0.tar.gz
Windows二进制	quantro_1.24.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	quantro_1.24.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/quantro
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/quantro
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/quantro/
软件包下载报告	下载数据