此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见qcmetrics.
Bioconductor版本:3.12
该软件包为数据的一般质量控制提供了一个框架。它允许创建、管理和可视化单个或组质量控制指标,并生成各种格式的质量控制报告。
作者:Laurent Gatto [aut, cre]
维护者:Laurent Gatto < Laurent。Gatto at uclouvain.be>
引文(从R内,输入引用(“qcmetrics”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("qcmetrics")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“qcmetrics”)
超文本标记语言 | R脚本 | qcmetrics包小插图的索引文件 |
R脚本 | 用于质量控制和报告的“qcmetrics”基础设施 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | ImmunoOncology,MassSpectrometry,微阵列,蛋白质组学,质量控制,ReportWriting,软件,可视化 |
版本 | 1.28.0 |
在Bioconductor | BioC 2.13 (R-3.0)(7.5年) |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | R (>= 3.3) |
进口 | Biobase、方法、knitr、工具、喷嘴。R1,xtable,老鸨,S4Vectors |
链接 | |
建议 | affy,MSnbase,ggplot2,晶格,yaqcaffy,MAQCsubsetAFX,RforProteomics,AnnotationDbi,mzR,hgu133plus2cdf,BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/lgatto/qcmetrics |
BugReports | https://github.com/lgatto/qcmetrics/issues |
全靠我 | |
进口我 | MSstatsQC |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | qcmetrics_1.28.0.tar.gz |
Windows二进制 | qcmetrics_1.28.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | qcmetrics_1.28.0.tgz |
源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/qcmetrics |
源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/qcmetrics |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/qcmetrics/ |
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