pvac

DOI:10.18129 / B9.bioc.pvac

这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅pvac。

PCA-based基因筛选Affymetrix数组

Bioconductor版本:3.12

包包含函数的筛选基因变异的比例占第一主成分(PVAC)。

作者:小君Lu和皮埃尔·r·蒲式耳

维修工:陆小君< jlu276 gmail.com >,皮埃尔·r·蒲式耳<蒲式耳niehs.nih.gov >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(pvac)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (pvac)

PDF	R脚本	PCA-based基因筛选Affymetrix GeneChips
PDF		参考手册

细节

biocViews	微阵列,OneChannel,质量控制,软件
版本	1.38.0
Bioconductor自	BioC 2.8 (r - 2.13)(10年)
许可证	LGPL (> = 2.0)
取决于	R (> = 2.8.0)
进口	affy(> = 1.20.0),统计数据,Biobase
链接
建议	pbapply,affydata,ALLMLL,genefilter
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	pvac_1.38.0.tar.gz
Windows二进制	pvac_1.38.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	pvac_1.38.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pvac
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ pvac
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/pvac/
包下载报告	下载数据