pulsedSilac

DOI:10.18129 / B9.bioc.pulsedSilac

这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅pulsedSilac。

pulsed-SILAC定量蛋白质组学数据的分析

Bioconductor版本:3.12

这个包提供了一些工具,用于pulsed-SILAC数据分析。功能是提供组织数据,计算同位素比值,同位素分数,模型蛋白质周转,营业额比较模型,估计细胞生长和估计同位素回收。做一些可视化工具还包括基本数据探索,质量控制,条件比较,单个模型检验和模型的比较。

作者:马克•Pages-Gallego Tobias Dansen

维护人员:马克Pages-Gallego < M。在umcutrecht.nl PagesGallego >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“pulsedSilac”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“pulsedSilac”)

HTML	R脚本	Pulsed-SILAC数据分析
PDF		参考手册

细节

biocViews	蛋白质组学,软件
版本	1.4.0
Bioconductor自	BioC 3.10 (r - 3.6)(1.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.6.0)
进口	robustbase、方法、R.utils,taRifx,S4Vectors,SummarizedExperiment,ggplot2,ggridges,统计,跑龙套,UpSetR,cowplot、网格MuMIn
链接
建议	testthat(> =魅惑,knitr,rmarkdown,gridExtra
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	pulsedSilac_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	pulsedSilac_1.4.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	pulsedSilac_1.4.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pulsedSilac
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ pulsedSilac
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/pulsedSilac/
包下载报告	下载数据