projectR

DOI:10.18129 / B9.bioc.projectR

这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅projectR。

从主成分分析权重函数的投影,CoGAPS, NMF、相关性和集群

Bioconductor版本:3.12

函数的投影数据空间利用主成分分析法(PCA)定义,CoGAPS, NMF、相关性和集群。

作者:Gaurav沙玛,吉纳维芙Stein-O ' brien

维护人员:吉纳维芙Stein-O ' brien < gsteinobrien gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“projectR”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“projectR”)

PDF	R脚本	projectR
PDF		参考手册
文本		许可证

细节

biocViews	BiologicalQuestion,FunctionalPrediction,GeneRegulation,软件
版本	1.6.0
Bioconductor自	BioC 3.9 (r - 3.6)(2年)
许可证	GPL (= = 2)
取决于
进口	方法,集群统计数据,limma,CoGAPS,NMF,ROCR,ggalluvial,RColorBrewer,