后代
doi：10.18129/b9.bioc.progeny
该包适用于生物导体的3.12版；对于稳定的最新版本，请参阅后代。
途径反应性基因用于基因表达的活性推断
生物导体版本：3.12
该软件包提供了使用后代从基因表达推断途径活动的函数。它包含我们在出版物中推断出的线性模型“扰动 - 反应基因揭示了癌症基因表达中的信号足迹”。
作者：迈克尔·舒伯特[AUT]，Alberto Valdeolivas [CRE，CTB]
，克里斯蒂安·H·荷兰[CTB]，Igor Bulanov [CTB]，AurélienDugourd[CTB]
维护者：gmail.com上的Alberto Valdeolivas
引用（从r内，输入引用（“后代”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ progeny”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“后代”）
| html | R脚本 | 将后代应用于单细胞RNA-seq数据 |
| html | R脚本 | 后代途径签名：应用于批量转录组学 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 | |
| 文本 | 执照 |
细节
| 生物浏览 | 功能性预测，，，，基因表达，，，，结肠管制，，，，软件，，，，系统生物学 |
| 版本 | 1.12.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.6（R-3.4）（3.5岁） |
| 执照 | Apache许可证（== 2.0）|文件执照 |
| 要看 | R（> = 3.6.0） |
| 进口 | 生物酶，统计dplyr，，，，花花公子，，，，GGPLOT2，，，，Ggrepel，，，，栅格 |
| 链接 | |
| 建议 | 呼吸道，，，，Biomart，，，，Biocfilecache，，，，扫帚，，，，Seurat，，，，Singlecellexperiment，，，，deseq2，，，，生物使用，，，，尼特，，，，readr，，，，readxl，，，，pheatmap，，，，蒂布尔，，，，测试（> = 2.1.0） |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/saezlab/progeny |
| BugReports | https://github.com/saezlab/progeny/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | progeny_1.12.0.tar.gz |
| Windows二进制 | progeny_1.12.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | progeny_1.12.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/progeny |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：包装/后代 |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/progeny/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
