PQSFINDER
doi：10.18129/b9.bioc.pqsfinder
该包适用于生物导体的3.12版；对于稳定的最新版本，请参阅PQSFINDER。
识别潜在四链体形成序列
生物导体版本：3.12
PQSFINDER检测可能折叠成分子内G-四链体（G4）的DNA和RNA序列模式。与许多其他方法不同，PQSFinder能够检测到包含凸起或不匹配或具有长循环的G4的G4折叠的G4。PQSFinder还为G4测序数据上拟合的每个点击分配了整数得分，并对应于折叠G4的预期稳定性。
作者：Jiri Hon，Dominika Labudova，Matej Lexa和Tomas Martinek
维护者：jiri hon
引用（从r内，输入引用（“ pqsfinder”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ pqsfinder”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ PQSFinder”）
| html | R脚本 | PQSFinder：用户指南 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 | |
| 文本 | 执照 |
细节
| 生物浏览 | 结肠管制，，，，主题，，，，测序，，，，软件 |
| 版本 | 2.6.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.3（R-3.3）（5年） |
| 执照 | bsd_2_clause +文件执照 |
| 要看 | 生物弦 |
| 进口 | RCPP（> = 0.12.3），基因组机，，，，iranges，，，，S4VECTORS， 方法 |
| 链接 | RCPP，，，，BH（> = 1.69.0） |
| 建议 | 生物使用，，，，尼特，，，，GVIZ，，，，rtracklayer，，，，GGPLOT2，，，，bsgenome.hsapiens.ucsc.hg38，，，，测试，，，，Stringr，，，，Stringi |
| 系统要求 | GNU MAKE，C ++ 11 |
| 增强 | |
| URL | https://pqsfinder.fi.muni.cz |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | pqsfinder_2.6.0.tar.gz |
| Windows二进制 | pqsfinder_2.6.0.zip（32-和64位） |
| MacOS 10.13（高山脉） | pqsfinder_2.6.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pqsfinder |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/pqsfinder |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/pqsfinder/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
