plyranges

DOI:10.18129 / B9.bioc.plyranges

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见plyranges．

一个流畅的界面操作基因组范围

Bioconductor版本:3.12

一个类似dplyr的界面，用于与常见的Bioconductor类Ranges和GenomicRanges交互。通过提供一种语法和一致的方式来操作这些类，希望能够增加新Bioconductor用户的可访问性。

作者:Stuart Lee [aut, cre]、迈克尔·劳伦斯[aut, ctb]、黛安·库克[aut, ctb]、斯宾塞·奈斯特罗姆[ctb]

维护者:Stuart Lee < Lee。S at wehi.edu.au>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("plyranges")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“plyranges”)

超文本标记语言	R脚本	简介
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	报道，DataRepresentation，基础设施，软件，WorkflowStep
版本	1.10.0
在Bioconductor	BioC 3.7 (R-3.5)(3年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.5)，BiocGenerics，IRanges(> = 2.12.0),GenomicRanges(> = 1.28.4)
进口	方法,dplyr，rlang(> = 0.2.0),magrittr，tidyselect(> = 1.0.0),rtracklayer，GenomicAlignments，GenomeInfoDb，Rsamtools，S4Vectors(>= 0.23.10)， utils
链接
建议	knitr，BiocStyle，rmarkdown，testthat(> =魅惑,HelloRanges，HelloRangesData，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19，pasillaBamSubset，covr，ggplot2
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/sa-lee/plyranges
全靠我
进口我	BUSpaRse，dasper，fluentGenomics，methylCC，multicrispr，nearBynding
建议我	StructuralVariantAnnotation
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	plyranges_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	plyranges_1.10.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	plyranges_1.10.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/plyranges
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/plyranges
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/plyranges/
软件包下载报告	下载数据