此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见钢琴.
Bioconductor版本:3.12
Piano使用各种统计方法进行基因集分析,从不同的基因水平统计和广泛的基因集集合。此外,Piano包包含组合多个运行的基因集分析结果的功能。
作者:Leif Varemo Wigge <钢琴。RPKG在gmail.com>而且Intawat Nookaew
维护者:Leif Varemo Wigge <钢琴。RPKG在gmail.com>
引文(从R内,输入引用(钢琴)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("piano")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(钢琴)
R脚本 | 组学数据综合分析平台 | |
超文本标记语言 | R脚本 | 用钢琴进行基因组分析 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DifferentialExpression,GeneExpression,GeneSetEnrichment,微阵列,通路,预处理,质量控制,软件,可视化 |
版本 | 2.6.0 |
在Bioconductor | BioC 2.12 (R-3.0)(8年) |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | R (>= 3.5) |
进口 | BiocGenerics,Biobase,gplots,igraph,关系,marray,fgsea,闪亮的,DT,htmlwidgets,shinyjs,shinydashboard,visNetwork,尺度, grDevices,图形,统计,utils,方法 |
链接 | |
建议 | yeast2.db,rsbml,plotrix,limma,affy,钳子,affyPLM,gtools,biomaRt,降雪,AnnotationDbi,knitr,rmarkdown,BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://www.sysbio.se/piano |
BugReports | https://github.com/varemo/piano/issues |
全靠我 | |
进口我 | CoreGx |
建议我 | BloodCancerMultiOmics2017 |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | piano_2.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | piano_2.6.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | piano_2.6.0.tgz |
源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/piano |
源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/piano |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/piano/ |
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