phenopath

DOI:10.18129 / B9.bioc.phenopath

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见phenopath．

具有异质遗传和环境背景的基因组轨迹

Bioconductor版本:3.12

PhenoPath在异质遗传和环境背景的存在下推断基因组轨迹(伪时间)，并测试它们之间的相互作用。

作者:基兰·坎贝尔

维护者:Kieran Campbell

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("phenopath")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“phenopath”)

超文本标记语言	R脚本	装饰图案的标题
PDF		参考手册

细节

biocViews	贝叶斯，GeneExpression，ImmunoOncology，PrincipalComponent，RNASeq，SingleCell，软件
版本	1.14.0
在Bioconductor	BioC 3.6 (R-3.4)(3.5年)
许可证	Apache许可证(== 2.0)
取决于
进口	Rcpp(> = 0.12.8),SummarizedExperiment，方法，统计，dplyr，宠物猫，ggplot2，tidyr
链接	Rcpp
建议	knitr，rmarkdown，forcats，testthat，BiocStyle，SingleCellExperiment
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我	飞溅
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	phenopath_1.14.0.tar.gz
Windows二进制	phenopath_1.14.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	phenopath_1.14.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/phenopath
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/phenopath
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/phenopath/
软件包下载报告	下载数据