pathview

这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅pathview。

一组工具基于路径的数据集成和可视化

Bioconductor版本:3.12

Pathview工具集是基于路径的数据集成和可视化。这地图和呈现各种各样的生物相关数据通路图。所有用户需要的是提供数据并指定目标的途径。Pathview自动下载路径图数据、解析数据文件,将用户数据映射到路径,并呈现与映射的数据通路图。此外,Pathview还无缝地集成了通路和基因(浓缩)分析工具对大规模和完全自动化分析。

作者:Weijun罗

维护人员:Weijun罗< luo_weijun yahoo.com >

从内部引用(R,回车引用(“pathview”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“pathview”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“pathview”)

PDF	R脚本	Pathview:基于路径的数据集成和可视化
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DifferentialExpression,GeneExpression,GeneSetEnrichment,遗传学,GraphAndNetwork,代谢组学,微阵列,通路,蛋白质组学,