pathprint

DOI:10.18129 / B9.bioc.pathprint

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此包适用于Bioconductor 3.12版。此包已从Bioconductor中删除。有关最新的稳定发布版本，请参见pathprintGEOData．

基因表达阵列分析的通路指纹

Bioconductor版本:3.12

将作为表达表或GEO引用提供的基因表达数组转换为“通路指纹”的算法，“通路指纹”是一组通路中表示高(1)、低(-1)或不重要(0)表达的离散三元分数向量。

作者:Gabriel Altschuler, Sokratis Kariotis

维护者:Sokratis Kariotis

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	GeneExpression，KEGG，Reactome，软件，转录
版本	1.20.0
在Bioconductor	BioC 3.5 (R-3.4)(4年)
许可证	GPL
取决于	R (>= 3.4)
进口	统计,跑龙套
链接
建议	所有，GEOquery，pathprintGEOData，SummarizedExperiment
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我	pathprintGEOData
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pathprint
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/pathprint
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/pathprint/
软件包下载报告	下载数据