packFinder

DOI:10.18129 / B9.bioc.packFinder

这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅packFinder

新创的注释Pack-TYPE转座的元素

Bioconductor版本:3.12

在硅片pack-TYPE转座子发现算法和工具。过滤器给定基因组DNA转座子和独有的属性提供的调查工具返回匹配。序列输入DNAString格式和范围作为dataframe返回(返回的格式as.dataframe(农庄))。

作者:杰克Gisby (aut (cre),马可Catoni (aut)

维护人员:杰克Gisby < jackgisby gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(“packFinder”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“packFinder”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“packFinder”)

HTML R脚本 packFinder
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 注释,遗传学,SequenceMatching,软件
版本 1.2.0
Bioconductor自 BioC 3.11 (r - 4.0)(1年)
许可证 GPL-2
取决于 R (> = 4.0.0)
进口 Biostrings,GenomicRanges,公里,、方法、IRanges,S4Vectors
链接
建议 biomartr,knitr,rmarkdown,testthat,dendextend,biocViews,BiocCheck,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/jackgisby/packFinder
BugReports https://github.com/jackgisby/packFinder/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 packFinder_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 packFinder_1.2.0.zip
macOS 10.13(高山脉) packFinder_1.2.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/packFinder
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ packFinder
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/packFinder/
包下载报告 下载数据

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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网