此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见pRoloc.
Bioconductor版本:3.12
pRoloc包实现了机器学习和可视化方法,用于定量质谱数据的分析和综合,以可靠地推断蛋白质亚细胞定位。
作者:劳伦特·盖托,奥利弗·克鲁克和丽莎·m·布雷克尔斯,托马斯·伯格和塞缪尔·维佐雷克撰稿
维护者:Laurent Gatto < Laurent。Gatto at uclouvain.be>
引文(从R内,输入引用(“pRoloc”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("pRoloc")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“pRoloc”)
超文本标记语言 | R脚本 | 空间蛋白质组学的迁移学习算法 |
超文本标记语言 | R脚本 | 注释空间蛋白质组数据 |
超文本标记语言 | R脚本 | 贝叶斯空间蛋白质组学与pRoloc |
超文本标记语言 | R脚本 | pRoloc中提供的机器学习技术 |
超文本标记语言 | R脚本 | 利用pRoloc进行空间蛋白质组学数据分析 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
视频 | pRoloc, pRolocdata和pRolocGUI |
biocViews | 分类,聚类,ImmunoOncology,MassSpectrometry,蛋白质组学,质量控制,软件 |
版本 | 1.30.0 |
在Bioconductor | BioC 2.12 (R-3.0)(8年) |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | R (>= 2.15),MSnbase(> = 1.19.20),MLInterfaces(>= 1.67.10),方法,Rcpp(> = 0.10.3),BiocParallel |
进口 | stats4,Biobase,mclust(> = 4.3),脱字符号,e1071,抽样,类,kernlab,晶格,nnet,randomForest,代理,模糊神经网络,hexbin,BiocGenerics统计数据,dendextend,RColorBrewer,尺度,质量,knitr,mvtnorm,LaplacesDemon,coda,mixtools,gtools,plyr,ggplot2,biomaRt, utils, grDevices,图形 |
链接 | Rcpp,RcppArmadillo |
建议 | testthat,rmarkdown,pRolocdata(> = 1.9.4),roxygen2,synapter,xtable,rgl,BiocStyle(> = 2.5.19),hpar(> = 1.15.3),dplyr,akima,字段,素食主义者,GO.db,AnnotationDbi,Rtsne(> = 0.13),nipals,重塑 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/lgatto/pRoloc |
BugReports | https://github.com/lgatto/pRoloc/issues |
全靠我 | pRolocGUI,蛋白质组学 |
进口我 | |
建议我 | MSnbase,pRolocdata,RforProteomics |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | pRoloc_1.30.0.tar.gz |
Windows二进制 | pRoloc_1.30.0.zip(32位和64位) |
macOS 10.13 (High Sierra) | pRoloc_1.30.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pRoloc |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/pRoloc |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/pRoloc/ |
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