nucleoSim

DOI:10.18129 / B9.bioc.nucleoSim

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见nucleoSim．

生成合成核小体映射

Bioconductor版本:3.12

该包可以生成覆盖核小体区域的读取的合成图谱，以及模拟下一代测序的正向和反向读取的合成图谱。用户可以在三种不同的读取定位分布中进行选择:Normal、Student和Uniform。

作者:Rawane Samb [aut]， Astrid Deschênes [cre, aut]， Pascal Belleau [aut]， Arnaud Droit [aut]

维护者:Astrid Deschenes

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("nucleoSim")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“nucleoSim”)

超文本标记语言	R脚本	生成合成核小体映射
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	对齐，遗传学，测序，软件，StatisticalMethod
版本	1.18.0
在Bioconductor	BioC 3.3 (R-3.3)(5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于
进口	统计数据,IRanges，S4Vectors、图形、方法
链接
建议	BiocStyle，BiocGenerics，knitr，rmarkdown，RUnit
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/arnauddroitlab/nucleoSim
BugReports	https://github.com/arnauddroitlab/nucleoSim/issues
全靠我
进口我
建议我	RJMCMCNucleosomes
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	nucleoSim_1.18.0.tar.gz
Windows二进制	nucleoSim_1.18.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	nucleoSim_1.18.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/nucleoSim
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/nucleoSim
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/nucleoSim/
软件包下载报告	下载数据