nucleoSim

DOI:10.18129 / B9.bioc.nucleoSim

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见nucleoSim

生成合成核小体映射

Bioconductor版本:3.12

该包可以生成覆盖核小体区域的读取的合成图谱,以及模拟下一代测序的正向和反向读取的合成图谱。用户可以在三种不同的读取定位分布中进行选择:Normal、Student和Uniform。

作者:Rawane Samb [aut], Astrid Deschênes [cre, aut], Pascal Belleau [aut], Arnaud Droit [aut]

维护者:Astrid Deschenes

引文(从R内,输入引用(“nucleoSim”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("nucleoSim")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“nucleoSim”)

超文本标记语言 R脚本 生成合成核小体映射
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 对齐遗传学测序软件StatisticalMethod
版本 1.18.0
在Bioconductor BioC 3.3 (R-3.3)(5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于
进口 统计数据,IRangesS4Vectors、图形、方法
链接
建议 BiocStyleBiocGenericsknitrrmarkdownRUnit
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/arnauddroitlab/nucleoSim
BugReports https://github.com/arnauddroitlab/nucleoSim/issues
全靠我
进口我
建议我 RJMCMCNucleosomes
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 nucleoSim_1.18.0.tar.gz
Windows二进制 nucleoSim_1.18.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) nucleoSim_1.18.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/nucleoSim
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/nucleoSim
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/nucleoSim/
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  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网