此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见myvariant.
Bioconductor版本:3.12
info是变体注释资源的综合聚合。myvariant是查询myvariant .info服务的包装器
作者:亚当·马克
维护者:Adam Mark, Chunlei Wu
引文(从R内,输入引用(“myvariant”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“myvariant”)
R脚本 | 使用MyVariant。R | |
参考手册 |
biocViews | 注释,GenomicVariation,软件,VariantAnnotation |
版本 | 1.20.0 |
在Bioconductor | BioC 3.2 (R-3.2)(5.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 3.2.1),VariantAnnotation |
进口 | httr,jsonlite,S4Vectors,Hmisc,plyr,magrittr,GenomeInfoDb |
链接 | |
建议 | BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | myvariant_1.20.0.tar.gz |
Windows二进制 | myvariant_1.20.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | myvariant_1.20.0.tgz |
源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/myvariant |
源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/myvariant |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/myvariant/ |
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