msgbsR

DOI:10.18129 / B9.bioc.msgbsR

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见msgbsR

msgbsR:甲基化敏感基因分型测序(MS-GBS) R功能

Bioconductor版本:3.12

用于MS-GBS实验分析的管道。

作者:本杰明·梅恩

维护者:Benjamin Mayne < Benjamin。梅恩在adelaide.edu.au>

引文(从R内,输入引用(“msgbsR”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("msgbsR")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“msgbsR”)

PDF R脚本 msgbsR_Example
PDF 参考手册

细节

biocViews DataImportDifferentialMethylation表观遗传学ImmunoOncologyMethylSeq软件
版本 1.14.0
在Bioconductor BioC 3.5 (R-3.4)(4年)
许可证 GPL-2
取决于 R (>= 3.4),GenomicRanges、方法
进口 BSgenomeeasyRNASeq刨边机GenomicAlignmentsGenomicFeaturesGenomeInfoDbggbioggplot2IRanges平行,plyrRsamtoolsR.utils统计数据,SummarizedExperimentS4Vectors,跑龙套
链接
建议 roxygen2BSgenome.Rnorvegicus.UCSC.rn6
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 msgbsR_1.14.0.tar.gz
Windows二进制 msgbsR_1.14.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) msgbsR_1.14.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/msgbsR
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/msgbsR
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/msgbsR/
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