微生物塑料
doi：10.18129/b9.bioc.microbiomeexplorer
该包适用于生物导体的3.12版；对于稳定的最新版本，请参阅微生物塑料。
微生物组勘探应用程序
生物导体版本：3.12
Microbiomeexplorer R软件包旨在促进标记 - 基因调查功能数据的分析和可视化。它允许用户通过命令行或包含包含的交互式闪亮应用程序执行和可视化典型的微生物组分析工作流程。除了应用常见的分析工作流外，该应用程序还可以使自动分析报告生成。
作者：Joseph Paulson [Aut]，Janina Reeder [AUT，CRE]，Mo Huang [AUT]，Genentech [CPH，FND]
维护者：Janina Reeder
引用（从r内，输入引用（“微生物塑料”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ Microbiomeexplorer”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“微生物塑料”）
| html | R脚本 | 微生物塑料 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 | |
| 文本 | 执照 |
细节
| 生物浏览 | 分类，，，，聚类，，，，差异性，，，，遗传因素，，，，免疫学，，，，宏基因组学，，，，微生物组，，，，多重组合，，，，正常化，，，，测序，，，，软件，，，，可视化 |
| 版本 | 1.0.1 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.12（R-4.0）（0.5岁） |
| 执照 | 麻省理工学院 +文件执照 |
| 要看 | 闪亮的，，，，马格里特，，，，元基因组，，，，生物酶 |
| 进口 | Shinyjs，，，，发光的dashboard，，，，Shinycsssloaders，，，，闪亮的widgets，，，，rmarkDown（> = 1.9.0），deseq2，，，，rcolorbrewer，，，，dplyr，，，，花花公子，，，，rlang，，，，尼特，，，，readr，，，，DT（> = 0.12.0），生物形式， 工具，Stringr，，，，素食主义者，，，，矩阵，，，，热图，，，，车，，，，扫帚，，，，林玛，，，，RESHAPE2，，，，蒂布尔，，，，福卡，，，，橄榄酸， 方法，情节（> = 4.9.1） |
| 链接 | |
| 建议 | V8，，，，测试（> = 2.1.0） |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | MicrobiomeExplorer_1.0.1.tar.gz |
| Windows二进制 | MicrobiomeExplorer_1.0.1.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | MicrobiomeExplorer_1.0.1.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/microbiomeexplorer |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/microbiomeexplorer |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/microbiomeexplorer/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
