微生物组

DOI:10.18129 / B9.bioc.microbiome

这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅微生物组。

微生物分析

Bioconductor版本:3.12

公用事业进行微生物分析。

作者:狮子座拉赫蒂(aut (cre),苏达山谢蒂(aut)

维护人员:狮子座拉赫蒂<狮子座。拉赫蒂在iki.fi >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(微生物)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(微生物)

HTML	R脚本	微生物R包
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	宏基因组,微生物组,测序,软件,SystemsBiology
版本	1.12.0
Bioconductor自	BioC 3.6 (r - 3.4)(3.5年)
许可证	BSD_2_clause +文件许可证
取决于	R (> = 3.6.0),phyloseq,ggplot2
进口	dplyr,reshape2,Rtsne,尺度统计数据,宠物猫,tidyr跑龙套,素食主义者
链接
建议	BiocGenerics,BiocStyle,开罗,knitcitations,knitr,rmarkdown,testthat
SystemRequirements
增强了
URL	http://microbiome.github.io/microbiome
BugReports	https://github.com/microbiome/microbiome/issues
取决于我
进口我	ANCOMBC
建议我	ANCOMBC
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	microbiome_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	microbiome_1.12.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	microbiome_1.12.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/microbiome
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/微生物
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/microbiome/
包下载报告	下载数据