miRspongeR

DOI:10.18129 / B9.bioc.miRspongeR

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见miRspongeR．

miRNA海绵相互作用网络和模块的鉴定与分析

Bioconductor版本:3.12

该软件包提供了研究miRNA海绵(也称为ceRNA或miRNA诱饵)的几个功能，包括流行的识别miRNA海绵相互作用的方法，整合不同方法的miRNA海绵相互作用的集成方法，以及验证miRNA海绵相互作用、推断miRNA海绵模块、对模块进行富集分析、对模块进行生存分析的功能。

作者:张俊鹏

维护者:张俊鹏

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install(" mirsponge ")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“miRspongeR”)

超文本标记语言	R脚本	mirsponge:鉴定和分析miRNA海绵相互作用网络和模块
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文本		新闻

细节

biocViews	BiomedicalInformatics，GeneExpression，微阵列，NetworkEnrichment，软件，生存
版本	1.16.2
在Bioconductor	BioC 3.9 (R-3.6)(2年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.5.0)
进口	corpcor平行,igraph，制程，clusterProfiler，ReactomePA，剂量，生存， grDevices，图形，统计，varhandle，linkcomm跑龙套,Rcpp，org.Hs.eg.db
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown，testthat
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/zhangjunpeng411/miRspongeR/issues
全靠我
进口我	miRSM
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	miRspongeR_1.16.2.tar.gz
Windows二进制	miRspongeR_1.16.2.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	miRspongeR_1.16.2.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/miRspongeR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ mirsponge
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/miRspongeR/
软件包下载报告	下载数据