miRmine

DOI:10.18129 / B9.bioc.miRmine

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见miRmine

数据包与miRmine数据库中的miRNA-seq数据集作为rangedsummarizeexperiment

Bioconductor版本:3.12

miRmine数据库是来自不同公开的miRNA-seq数据集的表达配置文件的集合,Panwar等人(2017)miRmine: a database of Human miRNA expression,使用此数据包作为rangedsummarizeexperiment准备。

作者:Dusan Randjelovic [aut, cre]

维护者:Dusan Randjelovic < Dusan。Randjelovic在sbgenomics.com>

引文(从R内,输入引用(“miRmine”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("miRmine")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“miRmine”)

超文本标记语言 R脚本 miRmine
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews ExpressionDataHomo_sapiens_DataRNASeqDataSequencingData软件
版本 1.12.0
在Bioconductor BioC 3.6 (R-3.4)(3.5年)
许可证 GPL (>= 3)
取决于 R (>= 3.4),SummarizedExperiment
进口
链接
建议 BiocStyleknitrrmarkdownDESeq2
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 miRmine_1.12.0.tar.gz
Windows二进制 miRmine_1.12.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) miRmine_1.12.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/miRmine
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/miRmine
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/miRmine/
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