miRmine

DOI:10.18129 / B9.bioc.miRmine

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见miRmine．

数据包与miRmine数据库中的miRNA-seq数据集作为rangedsummarizeexperiment

Bioconductor版本:3.12

miRmine数据库是来自不同公开的miRNA-seq数据集的表达配置文件的集合，Panwar等人(2017)miRmine: a database of Human miRNA expression，使用此数据包作为rangedsummarizeexperiment准备。

作者:Dusan Randjelovic [aut, cre]

维护者:Dusan Randjelovic < Dusan。Randjelovic在sbgenomics.com>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("miRmine")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“miRmine”)

超文本标记语言	R脚本	miRmine
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ExpressionData，Homo_sapiens_Data，RNASeqData，SequencingData，软件
版本	1.12.0
在Bioconductor	BioC 3.6 (R-3.4)(3.5年)
许可证	GPL (>= 3)
取决于	R (>= 3.4)，SummarizedExperiment
进口
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown，DESeq2
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	miRmine_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	miRmine_1.12.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	miRmine_1.12.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/miRmine
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/miRmine
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/miRmine/
软件包下载报告	下载数据