methylInheritance

DOI:10.18129 / B9.bioc.methylInheritance

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见methylInheritance

基于置换的分析将多代保守差异甲基化元素与治疗效果联系起来

Bioconductor版本:3.12

基于蒙特卡罗抽样的排列分析,用于检验以下假设:几代之间保守的差异甲基化元素的数量与从处理中继承的效应有关,并且可以忽略随机效应。

作者:Astrid Deschênes, Pascal Belleau和Arnaud Droit

维护者:Astrid Deschenes

引文(从R内,输入引用(“methylInheritance”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install(" methyllinheritance ")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

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browseVignettes(“methylInheritance”)

超文本标记语言 R脚本 基于置换的分析将多代保守差异甲基化元素与治疗效果联系起来
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文本 新闻

细节

biocViews BiologicalQuestionDNAMethylationDifferentialMethylation表观遗传学ImmunoOncologyMethylSeq测序软件StatisticalMethodWholeGenome
版本 1.14.0
在Bioconductor BioC 3.5 (R-3.4)(4年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 3.5)
进口 methylKitBiocParallelGenomicRangesIRangesS4Vectors,方法,并行,ggplot2gridExtra字谜
链接
建议 BiocStyleBiocGenericsknitrrmarkdownRUnitmethInheritSim
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/adeschen/methylInheritance
BugReports https://github.com/adeschen/methylInheritance/issues
全靠我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 methylInheritance_1.14.0.tar.gz
Windows二进制 methylInheritance_1.14.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) methylInheritance_1.14.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/methylInheritance
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/methylInheritance
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/methylInheritance/
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