methylCC

DOI:10.18129 / B9.bioc.methylCC

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见methylCC．

估计DNA甲基化样本中全血的细胞组成

Bioconductor版本:3.12

在任何平台技术(微阵列和测序)上测量的DNA甲基化全血样本的细胞组成的估计工具。

作者:Stephanie C. Hicks [aut, cre]，拉斐尔·伊里扎里[au]

维护者:Stephanie C. Hicks

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("methylCC")

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文档

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browseVignettes(“methylCC”)

超文本标记语言	R脚本	methylCC用户指南
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文本		新闻

细节

biocViews	DNAMethylation，MethylSeq，MethylationArray，微阵列，测序，软件，WholeGenome
版本	1.4.0
在Bioconductor	BioC 3.10 (R-3.6)(1.5年)
许可证	Cc乘4.0
取决于	R (>= 3.6)，FlowSorted.Blood.450k
进口	Biobase，GenomicRanges，IRanges，S4Vectors，dplyr，magrittr，minfi，bsseq，quadprog，plyranges，统计，utils，bumphunter，genefilter、方法、IlluminaHumanMethylation450kmanifest，IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19
链接
建议	knitr，testthat(> =魅惑,BiocGenerics，BiocStyle，tidyr，ggplot2
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/stephaniehicks/methylCC/
BugReports	https://github.com/stephaniehicks/methylCC/
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包档案

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源包	methylCC_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	methylCC_1.4.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	methylCC_1.4.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/methylCC
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/methylCC
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/methylCC/
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