甲基分析
doi：10.18129/b9.bioc.Methyanalysis
该包适用于生物导体的3.12版；对于稳定的最新版本，请参阅甲基分析。
DNA甲基化数据分析和可视化
生物导体版本：3.12
甲基分析套件旨在进行DNA甲基化数据分析和可视化。定义了Methygenoset类，以将染色体位置信息与数据保持一致。该软件包还包括估计Methy-Seq数据中甲基化水平的功能。
作者：Pan Du，Richard Bourgon
维护者：lei huang
引用（从r内，输入引用（“甲基分析”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ methyanalysis”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“甲基分析”）
| R脚本 | 甲基分析套件的介绍 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | DNAMETHYLATY，，，，微阵列，，，，软件，，，，可视化 |
| 版本 | 1.32.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.11（R-2.15）（8。5年） |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | r（> = 2.10），网格，生物基因，，，，iranges，，，，GenomeInfodB（> = 1.22.0），基因组机，，，，生物酶（> = 2.34.0），org.hs.eg.db |
| 进口 | grdevices，统计，utils，Lumi，，，，甲基菌，，，，GVIZ，，，，Genoset，，，，总结性特征，，，，iranges，，，，基因组机，，，，变体，，，，rtracklayer，，，，BigMemoryExtras，，，，GenomicFeatures，，，，注释，，，，生物酶（> = 2.5.5），AnnotationDbi，，，，GeneFilter，，，，Biomart，方法，并行 |
| 链接 | |
| 建议 | FDB.Infinium -Methylation.hg19，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg19 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | 甲基菌 |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | Methyanalysis_1.32.0.tar.gz |
| Windows二进制 | Methyanalysis_1.31.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | Methyanalysis_1.32.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/methyanalysis |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：包装/甲基分析 |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/methyanalysis/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
