metaseqR

DOI:10.18129 / B9.bioc.metaseqR

这个包是弃用。它可能会从Bioconductor删除。请参考包临终的指导方针为更多的信息。

这个包是Bioconductor的3.12版本。这个包已经从Bioconductor删除。最后稳定,最新的发布版本,请参阅metaseqR(见替代metaseqR2)。

R包RNA-Seq数据的分析和结果报告通过结合多个统计算法。

Bioconductor版本:3.12

提供了一个接口几个正常化RNA-Seq基因表达数据和统计测试包。此外,它创造了几次诊断阴谋,执行combinining荟萃分析的几个统计测试的结果和报告结果以互动的方式。

作者:Panagiotis Moulos < Moulos在fleming.gr >

维护人员:Panagiotis Moulos < Moulos在fleming.gr >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“metaseqR”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“metaseqR”)

PDF	R脚本	RNA-Seq数据分析使用与metaseqR mulitple统计算法
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression,GeneExpression,ImmunoOncology,归一化,预处理,质量控制,RNASeq,ReportWriting,软件,WorkflowStep
版本	1.30.0
Bioconductor自	BioC 2.14 (r - 3.1)(7年)
许可证	GPL (> = 3)
取决于	R (> = 3.4.0),EDASeq,DESeq,limma,qvalue
进口	刨边机,NOISeq,baySeq,NBPSeq,biomaRt跑龙套,gplots,corrplot,vsn,酿造,rjson,log4r
链接
建议	BiocGenerics,GenomicRanges,rtracklayer,Rsamtools,survcomp,维恩图,knitr,动物园,RUnit,BiocManager,BSgenome,RSQLite
SystemRequirements
增强了	平行,移行细胞癌,RMySQL
URL	http://www.fleming.gr
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	metaseqR_1.30.0.tar.gz
Windows二进制	metaseqR_1.30.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	metaseqR_1.30.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/metaseqR
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ metaseqR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/metaseqR/
包下载报告	下载数据