mbkmeans

DOI:10.18129 / B9.bioc.mbkmeans

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见mbkmeans．

单细胞RNA-seq的小批量K-means聚类

Bioconductor版本:3.12

为大型数据集实现小批量k-means算法，包括支持磁盘上的数据表示。

作者:倪宇伟[aut, cph]， Davide Risso [aut, cre, cph]， Stephanie Hicks [aut, cph]， Elizabeth Purdom [aut, cph]

维护者:Davide Risso < Risso。Davide在gmail.com>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("mbkmeans")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“mbkmeans”)

超文本标记语言	R脚本	mbkmeans装饰图案
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	聚类，GeneExpression，RNASeq，测序，SingleCell，软件，转录组
版本	1.6.1
在Bioconductor	BioC 3.9 (R-3.6)(2年)
许可证	MIT +文件许可证
取决于	R (>= 3.6)
进口	方法,DelayedArray，Rcpp，S4Vectors，SingleCellExperiment，SummarizedExperiment，咆哮，ClusterR，benchmarkme，矩阵，BiocParallel
链接	Rcpp，RcppArmadillo(> = 0.7.2),Rhdf5lib，beachmat，ClusterR
建议	beachmat，HDF5Array，Rhdf5lib，BiocStyle，TENxPBMCData，嘘，DelayedMatrixStats，knitr，testthat
SystemRequirements	c++ 11
增强了
URL
BugReports	https://github.com/drisso/mbkmeans/issues
全靠我
进口我	clusterExperiment
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	mbkmeans_1.6.1.tar.gz
Windows二进制	mbkmeans_1.6.1.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	mbkmeans_1.6.1.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mbkmeans
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/mbkmeans
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/mbkmeans/
软件包下载报告	下载数据