该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅MACAT。
生物导体版本:3.12
该文库包含研究差异基因表达与基因染色体定位之间的联系。MACAT是由涉及肿瘤细胞中大染色体区域的现象的常见观察到的动机。MACAT是实施一种统计方法,用于识别明显差异表达的染色体区域。该功能已在有关急性淋巴细胞白血病的公开数据集上进行了测试(Yeoh等人Cell 2002),该数据在“ Stjudem”库中提供了。
作者:本杰明·乔治(Benjamin Georgi),马蒂亚斯·海尼格(Matthias Heinig),斯特凡·罗普克(Stefan Roepcke),塞巴斯蒂安·施梅尔(Sebastian Schmeier),乔恩·托德林(Joern Toedling)
维护者:joern toedling
引用(从r内,输入引用(“ Macat”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ macat”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Macat”)
R脚本 | 微阵列染色体分析工具 | |
参考手册 |
生物浏览 | 差异性,,,,微阵列,,,,软件,,,,可视化 |
版本 | 1.64.0 |
在生物导体中 | Bioc 1.6(R-2.1)或更早(> 16年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | 生物酶,,,,注释 |
进口 | |
链接 | |
建议 | HGU95AV2.DB,,,,Stjudem |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | macat_1.64.0.tar.gz |
Windows二进制 | macat_1.64.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | macat_1.64.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/macat |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/macat |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/macat/ |
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