MACAT

doi:10.18129/b9.bioc.macat

该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅MACAT

微阵列染色体分析工具

生物导体版本:3.12

该文库包含研究差异基因表达与基因染色体定位之间的联系。MACAT是由涉及肿瘤细胞中大染色体区域的现象的常见观察到的动机。MACAT是实施一种统计方法,用于识别明显差异表达的染色体区域。该功能已在有关急性淋巴细胞白血病的公开数据集上进行了测试(Yeoh等人Cell 2002),该数据在“ Stjudem”库中提供了。

作者:本杰明·乔治(Benjamin Georgi),马蒂亚斯·海尼格(Matthias Heinig),斯特凡·罗普克(Stefan Roepcke),塞巴斯蒂安·施梅尔(Sebastian Schmeier),乔恩·托德林(Joern Toedling)

维护者:joern toedling

引用(从r内,输入引用(“ Macat”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ macat”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

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Browsevignettes(“ Macat”)

PDF R脚本 微阵列染色体分析工具
PDF 参考手册

细节

生物浏览 差异性,,,,微阵列,,,,软件,,,,可视化
版本 1.64.0
在生物导体中 Bioc 1.6(R-2.1)或更早(> 16年)
执照 艺术2.0
要看 生物酶,,,,注释
进口
链接
建议 HGU95AV2.DB,,,,Stjudem
系统要求
增强
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取决于我
进口我
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构建报告

包装档案

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源包 macat_1.64.0.tar.gz
Windows二进制 macat_1.64.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) macat_1.64.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/macat
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/macat
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/macat/
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