mBPCR

DOI:10.18129 / B9.bioc.mBPCR

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见mBPCR

贝叶斯分段常数回归估计DNA拷贝数

Bioconductor版本:3.12

它包含了使用mBPCR估计DNA拷贝数剖面的功能,目的是检测拷贝数变化的区域。

作者:P.M.V. Rancoita < Rancoita。Paola在gmail.com>,with contributions from M. Hutter

维护者:P.M.V. Rancoita < Rancoita。Paola在gmail.com>

引文(从R内,输入引用(“mBPCR”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("mBPCR")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“mBPCR”)

PDF R脚本 mBPCR
PDF 参考手册

细节

biocViews CopyNumberVariation微阵列单核苷酸多态性软件aCGH
版本 1.44.0
在Bioconductor BioC 2.5 (R-2.10)(11.5年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 oligoClassesGWASTools
进口 Biobase,图形,方法,utils, grDevices
链接
建议 xtable
SystemRequirements
增强了
URL http://www.idsia.ch/~paola/mBPCR
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 mBPCR_1.44.0.tar.gz
Windows二进制 mBPCR_1.44.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) mBPCR_1.44.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mBPCR
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/mBPCR
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/mBPCR/
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Bioconductor

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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网