loci2path

doi:10.18129/b9.bioc.loci2Path

该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅loci2path

基因座:基于组织特异性表达QTL的基因组间隔的调节注释

生物导体版本:3.12

Loci2Path对eqTL进行了统计富集分析,对基因组感兴趣的基因组区域进行了统计。使用来自MSIGDB的基因型组织表达(GTEX)项目和途径收集提供的EQTL集合。

作者:Tianlei Xu

维护者:tianlei xu

引用(从r内,输入引用(“ loci2path”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ loci2path”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ loci2path”)

html R脚本 loci2path
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 生物卡尔塔,,,,覆盖范围,,,,功能基因组学,,,,基因表达,,,,基因烯,,,,遗传学,,,,测序,,,,软件
版本 1.10.0
在生物导体中 Bioc 3.7(R-3.5)(3年)
执照 艺术2.0
要看 R(> = 3.4)
进口 pheatmap,,,,WordCloud,,,,rcolorbrewer,,,,Data.Table,方法,grdevices,统计,图形,基因组机,,,,生物比较,,,,S4VECTORS
链接
建议 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown
系统要求
增强
URL https://github.com/stanleyxu/loci2path
BugReports https://github.com/stanleyxu/loci2path/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 loci2path_1.10.0.tar.gz
Windows二进制 loci2path_1.10.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) loci2path_1.10.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/loci2path
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/loci2path
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/loci2path/
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