此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见iCOBRA.
Bioconductor版本:3.12
这个包提供了用于评估排名和二元分类(分配)方法的性能指标的计算和可视化功能。它还包含一个用于交互式搜索结果的闪亮应用程序。
作者:Charlotte Soneson [aut, cre]
维护者:Charlotte Soneson
引文(从R内,输入引用(“iCOBRA”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("iCOBRA")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“iCOBRA”)
超文本标记语言 | R脚本 | iCOBRA用户指南 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 分类,软件 |
版本 | 1.18.1 |
在Bioconductor | BioC 3.3 (R-3.3)(5年) |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | R (>= 3.4) |
进口 | 闪亮的(> = 0.9.1.9008),shinydashboard,shinyBS,reshape2,ggplot2(> = 2.0.0),尺度,ROCR,dplyr,DT,limma、方法、UpSetR |
链接 | |
建议 | knitr,testthat,rmarkdown |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/markrobinsonuzh/iCOBRA |
BugReports | https://github.com/markrobinsonuzh/iCOBRA/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | 马斯喀特,SummarizedBenchmark |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | iCOBRA_1.18.1.tar.gz |
Windows二进制 | iCOBRA_1.18.1.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | iCOBRA_1.18.1.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/iCOBRA |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/iCOBRA |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/iCOBRA/ |
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