Gwascat

doi:10.18129/b9.bioc.gwascat

该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅Gwascat

在EMBL-EBI GWAS目录中代表和建模数据

生物导体版本:3.12

在EMBL-EBI GWAS目录中代表和建模数据。

作者:vj Carey

维护者:vj Carey

引用(从r内,输入引用(“ Gwascat”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ gwascat”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Gwascat”)

html R脚本 GWASCAT- GRANGE for GWAS HITS中的EBI目录
html R脚本 Gwascat:结构和查询NHGRI GWAS目录
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 遗传学,,,,软件
版本 2.22.0
在生物导体中 Bioc 2.10(R-2.15)(9年)
执照 艺术2.0
要看 R(> = 3.5.0),方法
进口 S4VECTORS(> = 0.9.25),iranges,,,,GenomeInfodB,,,,基因组机(> = 1.29.6),GenomicFeatures,,,,readr,,,,生物弦,,,,AnnotationDbi,,,,Biocfilecache,,,,snpstats,,,,变体
链接
建议 do.db,,,,DT,,,,尼特,,,,rbgl,,,,测试,,,,GVIZ,,,,AnnotationHub,,,,rsamtools,,,,iranges,,,,图形,,,,GGBIO,,,,延迟,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg19,,,,org.hs.eg.db,,,,生物使用
系统要求
增强 snplocs.hsapiens.dbsnp144.grch37
URL
取决于我 举起,,,,vtpnet
进口我 Circrnaprofiler
建议我 GenomicsCores,,,,GQTLBASE,,,,gqtlstats,,,,grasp2db,,,,hmdbquery,,,,ldblock,,,,parglms,,,,tfutils
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 gwascat_2.22.0.tar.gz
Windows二进制 gwascat_2.22.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) gwascat_2.22.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gwascat
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/gwascat
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/gwascat/
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