该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅Gwascat。
生物导体版本:3.12
在EMBL-EBI GWAS目录中代表和建模数据。
作者:vj Carey
维护者:vj Carey
引用(从r内,输入引用(“ Gwascat”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ gwascat”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Gwascat”)
html | R脚本 | GWASCAT- GRANGE for GWAS HITS中的EBI目录 |
html | R脚本 | Gwascat:结构和查询NHGRI GWAS目录 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 遗传学,,,,软件 |
版本 | 2.22.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.10(R-2.15)(9年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | R(> = 3.5.0),方法 |
进口 | S4VECTORS(> = 0.9.25),iranges,,,,GenomeInfodB,,,,基因组机(> = 1.29.6),GenomicFeatures,,,,readr,,,,生物弦,,,,AnnotationDbi,,,,Biocfilecache,,,,snpstats,,,,变体 |
链接 | |
建议 | do.db,,,,DT,,,,尼特,,,,rbgl,,,,测试,,,,GVIZ,,,,AnnotationHub,,,,rsamtools,,,,iranges,,,,图形,,,,GGBIO,,,,延迟,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg19,,,,org.hs.eg.db,,,,生物使用 |
系统要求 | |
增强 | snplocs.hsapiens.dbsnp144.grch37 |
URL | |
取决于我 | 举起,,,,vtpnet |
进口我 | Circrnaprofiler |
建议我 | GenomicsCores,,,,GQTLBASE,,,,gqtlstats,,,,grasp2db,,,,hmdbquery,,,,ldblock,,,,parglms,,,,tfutils |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | gwascat_2.22.0.tar.gz |
Windows二进制 | gwascat_2.22.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | gwascat_2.22.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gwascat |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/gwascat |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/gwascat/ |
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