全球测试

doi:10.18129/b9.bioc.globaltest

该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅全球测试

测试与响应变量关联的协变量/特征组,并应用于基因集测试

生物导体版本:3.12

全局测试测试组的协变量(或特征)与响应变量关联。该软件包通过诊断图和多个测试实用程序实现了测试,以及几个功能,可促进该测试用于GO和KEGG术语的基因集测试。

作者:Jelle Goeman和Jan Oosting,由Livio Finos,Aldo Solari,Dominic Edelmann捐款

维护者:Jelle Goeman

引用(从r内,输入引用(“ GlobalTest”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ global -test”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ globaltest”)

PDF R脚本 全球测试
PDF 参考手册

细节

生物浏览 生物信息学,,,,差异性,,,,,,,,微阵列,,,,Onechannel,,,,途径,,,,软件
版本 5.44.0
在生物导体中 Bioc 1.6(R-2.1)或更早(> 16年)
执照 GPL(> = 2)
要看 方法,生存
进口 生物酶,,,,AnnotationDbi,,,,注释,图形
链接
建议 VSN,,,,golubeset,,,,keggrest,,,,Hu6800.db,,,,rgraphviz,,,,go.db,,,,lungexpression,,,,org.hs.eg.db,,,,gseabase,,,,受到惩罚,,,,GSS,,,,大量的,,,,引导,,,,rpart,,,,MSTATE
系统要求
增强
URL
取决于我 Globalancova
进口我 Biseq,,,,冠军,,,,Egsea,,,,SIM
建议我 topgo
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 globaltest_5.44.0.tar.gz
Windows二进制 globalTest_5.44.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) globaltest_5.44.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/globaltest
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/globaltest
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/globaltest/
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