glmGamPoi

DOI:10.18129 / B9.bioc.glmGamPoi

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见glmGamPoi．

拟合γ -泊松广义线性模型

Bioconductor版本:3.12

对过分散的计数数据拟合线性模型。该包可以估计过色散，并为矩阵输入拟合重复模型。它被设计用来处理大型输入数据集，因为它们通常发生在单细胞RNA-seq实验中。

作者:Constantin Ahlmann-Eltze [aut, cre]，迈克尔·勒夫[ctb]

维护者:Constantin Ahlmann-Eltze

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("glmGamPoi")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“glmGamPoi”)

超文本标记语言	R脚本	glmGamPoi快速入门
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	RNASeq，回归，SingleCell，软件
版本	1.2.0
在Bioconductor	BioC 3.11 (R-4.0)(1年)
许可证	GPL-3
取决于
进口	Rcpp，DelayedMatrixStats，matrixStats，DelayedArray，HDF5Array，SummarizedExperiment，方法，统计，utils，样条
链接	Rcpp，RcppArmadillo，beachmat
建议	testthat(> =魅惑,动物园，DESeq2，刨边机，limma，beachmat，质量，statmod，ggplot2，板凳上，BiocParallel，knitr，rmarkdown，BiocStyle，TENxPBMCData，食物
SystemRequirements	c++ 11
增强了
URL	https://github.com/const-ae/glmGamPoi
BugReports	https://github.com/const-ae/glmGamPoi/issues
全靠我
进口我
建议我	DESeq2
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	glmGamPoi_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	glmGamPoi_1.2.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	glmGamPoi_1.2.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/glmGamPoi
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/glmGamPoi
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/glmGamPoi/
软件包下载报告	下载数据