gespeR

DOI:10.18129 / B9.bioc.gespeR

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见gespeR．

基因特异性表型估计器

Bioconductor版本:3.12

从脱靶混杂RNAi筛选估计基因特异性表型。每个siRNA的表型是基于靶向和非靶向基因，使用正则化线性回归模型建模。

作者:Fabian sch密西根

维护者:Fabian sch密西根< Fabian。sch密西根在bsse.ethz.ch>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("gespeR")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“gespeR”)

PDF	R脚本	一个用于反卷积脱靶混淆RNAi屏幕的R包
PDF		参考手册

细节

biocViews	CellBasedAssays，GeneTarget，ImmunoOncology，预处理，回归，软件，可视化
版本	1.22.0
在Bioconductor	BioC 3.1 (R-3.2)(6年)
许可证	GPL-3
取决于	方法、图形ggplot2， r (>= 2.10)
进口	矩阵，glmnet，cellHTS2，Biobase，biomaRt，doParallel平行,foreach，reshape2，dplyr
链接
建议	knitr
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.cbg.ethz.ch/software/gespeR
全靠我
进口我	eiR
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	gespeR_1.22.0.tar.gz
Windows二进制	gespeR_1.22.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	gespeR_1.22.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gespeR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/gespeR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/gespeR/
软件包下载报告	下载数据