gespeR

DOI:10.18129 / B9.bioc.gespeR

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见gespeR

基因特异性表型估计器

Bioconductor版本:3.12

从脱靶混杂RNAi筛选估计基因特异性表型。每个siRNA的表型是基于靶向和非靶向基因,使用正则化线性回归模型建模。

作者:Fabian sch密西根

维护者:Fabian sch密西根< Fabian。sch密西根在bsse.ethz.ch>

引文(从R内,输入引用(“gespeR”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("gespeR")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“gespeR”)

PDF R脚本 一个用于反卷积脱靶混淆RNAi屏幕的R包
PDF 参考手册

细节

biocViews CellBasedAssaysGeneTargetImmunoOncology预处理回归软件可视化
版本 1.22.0
在Bioconductor BioC 3.1 (R-3.2)(6年)
许可证 GPL-3
取决于 方法、图形ggplot2, r (>= 2.10)
进口 矩阵glmnetcellHTS2BiobasebiomaRtdoParallel平行,foreachreshape2dplyr
链接
建议 knitr
SystemRequirements
增强了
URL http://www.cbg.ethz.ch/software/gespeR
全靠我
进口我 eiR
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 gespeR_1.22.0.tar.gz
Windows二进制 gespeR_1.22.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) gespeR_1.22.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gespeR
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/gespeR
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/gespeR/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网