该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅GCRMA。
生物导体版本:3.12
使用序列信息进行背景调整
作者:Jean(Zhijin)Wu,Rafael Irizarry,詹姆斯·麦克唐纳(James MacDonald
维护者:Z. Wu
引用(从r内,输入引用(“ GCRMA”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ gcrma”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ GCRMA”)
GCRMA1.2 | ||
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 微阵列,,,,Onechannel,,,,预处理,,,,软件 |
版本 | 2.62.0 |
在生物导体中 | Bioc 1.6(R-2.1)或更早(> 16年) |
执照 | LGPL |
要看 | r(> = 2.6.0),副词(> = 1.23.2),图形,方法,统计,utils |
进口 | 生物酶,,,,副词(> = 1.23.2),affyio(> = 1.13.3),xvector,,,,生物弦(> = 2.11.32),花键,生物管理器 |
链接 | |
建议 | Affydata,工具,花键,HGU95AV2CDF,,,,HGU95AV2Probe |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | Affyilm,,,,affyplm,,,,BGX,,,,mapredictdsc,,,,maskbad,,,,简单,,,,Webbioc |
进口我 | Affycoretools,,,,affylmgui,,,,简单 |
建议我 | AffyExpress,,,,Arraytools,,,,生物探测,,,,锅 |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | gcrma_2.62.0.tar.gz |
Windows二进制 | gcrma_2.62.0.zip(32-和64位) |
MacOS 10.13(高山脉) | gcrma_2.62.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gcrma |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/gcrma |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/gcrma/ |
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