此包适用于Bioconductor的3.12版本。此包已从Bioconductor中删除。有关最新的稳定发布版本,请参见gQTLstats.
Bioconductor版本:3.12
eQTL、mQTL、dsQTL等的计算效率分析。
作者:VJ Carey
维护者:VJ Carey
引用(从R中,输入引用(“gQTLstats”)
):
要安装此包,启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“gQTLstats”)
超文本标记语言 | R脚本 | gQTLstats:基因组特征的遗传学统计 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 软件 |
版本 | 1.21.3 |
在Bioconductor公司 | BioC 3.1 (R-3.2)(6年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 3.5.0),Homo.sapiens |
进口 | 方法,snpStats,BiocGenerics,S4Vectors(> = 0.9.25),IRanges,GenomeInfoDb,GenomicFiles,GenomicRanges,SummarizedExperiment,VariantAnnotation,Biobase,BatchJobs,gQTLBase,limma,mgcv,dplyr,AnnotationDbi,GenomicFeatures,ggplot2,reshape2,doParallel,foreach,ffbase,BBmisc,beeswarm,HardyWeinberg,图形,统计,工具,闪亮的,情节,erma,ggbeeswarm |
链接 | |
建议 | geuvPack,geuvStore2,Rsamtools,knitr,rmarkdown,ggbio,BiocStyle,RUnit,乘,gwascat,org.Hs.eg.db,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene,ldblock |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | yriMulti |
给我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | gQTLstats_1.21.3.tar.gz |
Windows二进制 | gQTLstats_1.21.3.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | gQTLstats_1.21.3.tgz |
源库 | git clone https://git.bioconductor.org/packages/gQTLstats |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/gQTLstats |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/gQTLstats/ |
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