funtooNorm

DOI:10.18129 / B9.bioc.funtooNorm

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见funtooNorm．

Infinium HumanMethylation450珠片试剂盒的归一化程序

Bioconductor版本:3.12

提供normalize Illumina Infinium Human Methylation 450 BeadChip (Illumina 450K)的功能，校正组织和/或细胞类型。

作者:西莉亚·格林伍德<西莉亚。格林伍德在麦吉尔大学。ca>，Stepan Grinek < Stepan。在ladydavis的Grinek。ca>， Maxime Turgeon < Maxime。麦吉尔的特金。ca>， Kathleen Klein < Kathleen。Klein在mail.mcgill.ca>

维护者:Kathleen Klein < Kathleen。Klein在mail.mcgill.ca>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("funtooNorm")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“funtooNorm”)

PDF	R脚本	Normalizing Illumina Infinium人类甲基化450k多种细胞类型与funtooNorm
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DNAMethylation，归一化，预处理，软件
版本	1.14.0
在Bioconductor	BioC 3.5 (R-3.4)(4年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.4)
进口	请，matrixStats，minfi、方法、IlluminaHumanMethylation450kmanifest，IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19，GenomeInfoDb， grDevices，图形，统计
链接
建议	prettydoc，minfiData，knitr，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	funtooNorm_1.14.0.tar.gz
Windows二进制	funtooNorm_1.14.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	funtooNorm_1.14.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/funtooNorm
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/funtooNorm
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/funtooNorm/
软件包下载报告	下载数据