flowWorkspace

DOI:10.18129 / B9.bioc.flowWorkspace

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见flowWorkspace．

表示门控和非门控细胞术数据集并与之交互的基础设施。

Bioconductor版本:3.12

这个包的设计是为了方便比较自动门控方法和在flowJo中进行的手动门控方法。这个包允许您将基本的flowJo工作区导入到BioConductor中，并使用flowCore功能从flowJo复制门控。将执行门控层次结构、样本组、补偿和转换，以便输出与flowJo分析匹配。

作者:Greg Finak, Mike Jiang

维护者:Greg Finak ，Mike Jiang ，Jake Wagner

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“flowWorkspace”)

超文本标记语言	R脚本	flowWorkspace简介:一个用于存储和操作门控流数据的包
超文本标记语言	R脚本	如何合并GatingSets
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		安装
文本		许可证

细节

biocViews	DataImport，DataRepresentation，FlowCytometry，ImmunoOncology，预处理，软件
版本	4.2.0
在Bioconductor	BioC 2.9 (R-2.14)(9.5年)
许可证	文件许可证
取决于	R (>= 3.5.0)
进口	Biobase，BiocGenerics，cytolib(> = 2.1.20),晶格，latticeExtra，XML，ggplot2，图，图形，grDevices，方法，统计，stats4, utils，RBGL、工具、Rgraphviz，data.table，dplyr，Rcpp，尺度，matrixStats，RcppParallel，RProtoBufLib，消化，aws.s3，aws.signature，flowCore(> = 2.1.1),ncdfFlow(> = 2.25.4)
链接	Rcpp，黑洞(> = 1.62.0-1),RProtoBufLib(> = 1.99.4),cytolib(> = 2.1.15),Rhdf5lib，RcppArmadillo，RcppParallel(> = 4.4.2-1)
建议	testthat，flowWorkspaceData(> = 2.23.2),knitr，ggcyto平行,CytoML，openCyto
SystemRequirements	GNU制作，c++ 11
增强了
URL
全靠我	ggcyto，highthroughputassays
进口我	CytoML，flowDensity，FlowSOM，flowStats，ImmuneSpaceR，openCyto，PeacoQC
建议我	催化剂，指南针，flowClust，flowCore
链接到我	CytoML
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	flowWorkspace_4.2.0.tar.gz
Windows二进制	flowWorkspace_4.2.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	flowWorkspace_4.2.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/flowWorkspace
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/flowWorkspace
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/flowWorkspace/
软件包下载报告	下载数据