flowspy

doi:10.18129/b9.bioc.flowspy

这个包是弃用。它可能会从生物导体中取出。请参考包装终止指南了解更多信息。

此软件包适用于生物导体的3.12版。该软件包已从生物导体中删除。有关最后一个稳定的最新版本版本,请参阅flowspy

用于流量和质量细胞仪数据的工具包

生物导体版本:3.12

用于流量和质量细胞术数据的轨迹推理和可视化工具包。Flowspy为流量和质量细胞仪数据提供了完整的分析工作流程。Flowspy可以是应用程序的有价值的工具,从降低聚类和维度重建到流量和质量细胞仪数据的轨迹重建和伪期权估计。

作者:Yuting Dai [AUT,CRE]

维护者:在sjtu.edu.cn>的dai

引用(从r内,输入引用(“ flowspy”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ flowspy”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ flowspy”)

html R脚本 快速开始
html quick_start_of_flowspy.html
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 蜂窝基,,,,细胞生物学,,,,聚类,,,,流程仪,,,,网络,,,,网络引导,,,,软件,,,,可视化
版本 1.4.0
在生物导体中 Bioc 3.10(R-3.6)(1。5年)
执照 GPL-3
要看 r(> = 3.6),Igraph
进口 流动,,,,RTSNE,,,,GGPLOT2,,,,命运,,,,Gmodels,,,,流动性,,,,生物酶,,,,矩阵,,,,流核,,,,SVA,,,,矩阵, 方法,mclust,,,,Prettydoc,,,,拉恩(> = 2.5),RCPP(> = 0.12.0),生物脑,,,,,,,,pheatmap,,,,散落,,,,UMAP,,,,STACTPLOT3D,,,,林玛,,,,Stringr,grdevices,网格,统计
链接 RCPP
建议 生物基因,,,,尼特,,,,rcolorbrewer,,,,rmarkDown,,,,测试,,,,生物使用
系统要求
增强
URL http://www.r-project.orghttps://github.com/jhuanglab/flowspy
BugReports https://github.com/jhuanglab/flowspy/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 flowspy_1.4.0.tar.gz
Windows二进制 flowspy_1.4.0.zip(32-和64位)
MacOS 10.13(高山脉) flowspy_1.4.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/flowspy
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/flowspy
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/flowspy/
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