flowSpecs

DOI:10.18129 / B9.bioc.flowSpecs

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见flowSpecs．

高维细胞术数据处理工具

Bioconductor版本:3.12

该软件包旨在填补传统细胞仪预处理软件的作用，用于光谱分解、转换、可视化和清理，并通过将流帧和流集转换为数据帧来帮助进一步的下游分析，如DepecheR。与flowcore兼容的自动1d门控/过滤功能在管道中。之所以选择这个软件包的名字，既是因为它将处理光谱细胞术，也是因为它有望为用户提供一副漂亮的眼镜，通过它来查看他们的数据。

作者:Jakob theorll [aut, cre]

维护者:Jakob定理< Jakob。定理在ndcn.ox.ac.uk>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“flowSpecs”)

超文本标记语言	R脚本	处理原始谱细胞仪文件的工作流示例
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	CellBasedAssays，DataImport，DataRepresentation，FlowCytometry，ImmunoOncology，归一化，SingleCell，软件，可视化
版本	1.4.0
在Bioconductor	BioC 3.10 (R-3.6)(1.5年)
许可证	MIT +文件许可证
取决于	R (>= 4.0)
进口	ggplot2(> = 3.1.0),BiocGenerics(> = 0.30.0),BiocParallel(> = 1.18.1),Biobase(> = 2.48.0),reshape2(> = 3),flowCore(> = 1.50.0),动物园(>= 1.8.6)，统计(>= 3.6.0)，方法(>= 3.6.0)
链接
建议	testthat，knitr，rmarkdown，BiocStyle，服饰
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/jtheorell/flowSpecs/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	flowSpecs_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	flowSpecs_1.4.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	flowSpecs_1.4.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/flowSpecs
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/flowSpecs
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/flowSpecs/
软件包下载报告	下载数据