流核

doi:10.18129/b9.bioc.flowcore

该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅流核

流核:流式细胞仪数据的基本结构

生物导体版本:3.12

提供S4数据结构和基本功能来处理流式细胞仪数据。

作者:B Ellis [aut],Perry Haaland [Aut],Florian Hahne [Aut],Nolwenn Le Meur [Aut],Nishant Gopalakrishnan [aut],Josef Spidlen [aut],Mike Jiang [Aut,Cre,Cre,Greg Finak [Greg Finak [Aut],Samuel Granjeaud [CTB]

维护者:Mike Jiang

引用(从r内,输入引用(“流核”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ flowcore”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“流核”)

PDF R脚本 流式细胞仪数据的基本功能
html fcs3.html
html hyperlog.notice.html
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 蜂窝基,,,,流程仪,,,,免疫学,,,,基础设施,,,,软件
版本 2.2.0
在生物导体中 Bioc 2.0(R-2.5)(14年)
执照 艺术2.0
要看 R(> = 3.5.0)
进口 生物酶,,,,生物基因(> = 0.29.2),Grdevices,图形,方法,统计,UTILS,STATS4,RCPP,,,,矩阵,,,,Cytolib(> = 1.9.15),S4VECTORS
链接 RCPP,,,,rcpparmadillo,,,,BH(> = 1.65.0.1),Cytolib(> = 1.7.2),rprotobuflib
建议 rgraphviz,,,,Flowviz,,,,FlowStats(> = 3.43.4),测试,,,,FlowWorkspace,,,,FlowWorkspacedata,,,,opencyto,,,,尼特,,,,ggcyto,,,,栅格
系统要求 GNU MAKE,C ++ 11
增强
URL
取决于我 流面,,,,Flowbin,,,,FlowClean,,,,流程,,,,FlowFiteXampleData,,,,FlowFP,,,,FlowMatch,,,,流动时间,,,,流传输,,,,Flowviz,,,,流量,,,,ggcyto,,,,hdcytodata,,,,HealthyFlowData,,,,高通量库,,,,免疫剂,,,,无限流,,,,ncdfflow
进口我 催化剂,,,,cmapr,,,,承认,,,,Cydar,,,,Cytodx,,,,胞胎,,,,细胞瘤,,,,细胞动力,,,,ddpcrclust,,,,diffcyt,,,,Flowai,,,,流面,,,,流动,,,,flowclust,,,,流量密度,,,,FlowFit,,,,流程,,,,Flowmerge,,,,流动性,,,,流动,,,,Flowspecs,,,,flowspy,,,,FlowStats,,,,流传输,,,,Flowtype,,,,流动性,,,,Flowviz,,,,FlowWorkspace,,,,守门员,,,,免疫空间,,,,Metacyto,,,,ncdfflow,,,,内感,,,,opencyto,,,,PEACOQC,,,,Scdataviz,,,,sconify
建议我 罗盘,,,,流动流体,,,,FlowRepositoryr,,,,rchyoptimyx
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 flowcore_2.2.0.tar.gz
Windows二进制 flowcore_2.2.0.zip(32-和64位)
MacOS 10.13(高山脉) flowcore_2.2.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/flowcore
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/流核
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/flowcore/
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