fCCAC

DOI:10.18129 / B9.bioc.fCCAC

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见fCCAC

功能典型相关分析用于评估核酸测序数据集之间的协方差

Bioconductor版本:3.12

应用功能典型相关分析评估核酸测序数据集的协方差,如染色质免疫沉淀后深度测序(ChIP-seq)。该包也可以用于其他类型的测序数据,如neMeRIP-seq(见PMID: 29489750)。

作者:Pedro Madrigal <生物信息学。gmail.com>的工程师

维护者:Pedro Madrigal <生物信息学。gmail.com>的工程师

引文(从R内,输入引用(“fCCAC”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("fCCAC")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“fCCAC”)

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文本 新闻

细节

biocViews 报道遗传学测序软件转录
版本 1.16.0
在Bioconductor BioC 3.4 (R-3.3)(4.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 3.3.0),S4VectorsIRangesGenomicRanges、网格
进口 食品及药物管理局RColorBrewergenomationggplot2ComplexHeatmap, grDevices, stats, utils
链接
建议 RUnitBiocGenericsBiocStyle
SystemRequirements
增强了
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 fCCAC_1.16.0.tar.gz
Windows二进制 fCCAC_1.16.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) fCCAC_1.16.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/fCCAC
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/fCCAC
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/fCCAC/
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