这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅epivizrStandalone。
Bioconductor版本:3.12
这个包导入epiviz JavaScript应用基因组数据可视化交互式可视化。epivizrServer的包是用来提供一个web服务器运行完全在r .这个独立的版本允许浏览任意基因组提供基因组注释Bioconductor包。
作者:赫克托耳Corrada布拉沃,Jayaram Kancherla
维修工:赫克托耳Corrada布拉沃< hcorrada gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“epivizrStandalone”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“epivizrStandalone”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“epivizrStandalone”)
HTML | 介绍epivizrStandalone | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | GUI,基础设施,软件,可视化 |
版本 | 1.18.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.3 (r - 3.3)(5年) |
许可证 | 麻省理工学院+文件许可证 |
取决于 | R (> = 3.2.3),epivizr(> = 2.3.6)方法 |
进口 | git2r,epivizrServer,GenomeInfoDb,BiocGenerics,GenomicFeatures,S4Vectors |
链接 | |
建议 | testthat,knitr,rmarkdown,OrganismDbi(> = 1.13.9),Mus.musculus,Biobase,BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | metavizr |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | epivizrStandalone_1.18.0.tar.gz |
Windows二进制 | epivizrStandalone_1.18.0.zip |
macOS 10.13(高山脉) | epivizrStandalone_1.18.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/epivizrStandalone |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ epivizrStandalone |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/epivizrStandalone/ |
包下载报告 | 下载数据 |