这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅drawProteins。
Bioconductor版本:3.12
这个包蛋白质图表来自Uniprot API输出。从JSON返回的命令,它会创建一个dataframe Uniprot功能的API。这个几何学dataframe可以使用基于ggplot2和基础R蛋白示意图。
作者:保罗•布伦南(aut (cre)
维修工:保罗·布伦南在gmail.com < brennanpincardiff >
从内部引用(R,回车引用(“drawProteins”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“drawProteins”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“drawProteins”)
HTML | R脚本 | 使用drawProteins |
HTML | R脚本 | 使用extract_transcripts drawProteins |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | FunctionalPrediction,蛋白质组学,软件,可视化 |
版本 | 1.10.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.7 (r - 3.5)(3年) |
许可证 | 麻省理工学院+文件许可证 |
取决于 | R (> = 4.0) |
进口 | ggplot2,httr,dplyr,readr,tidyr |
链接 | |
建议 | covr,testthat,knitr,rmarkdown,BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/brennanpincardiff/drawProteins |
BugReports | https://github.com/brennanpincardiff/drawProteins/issues/new |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | drawProteins_1.10.0.tar.gz |
Windows二进制 | drawProteins_1.10.0.zip |
macOS 10.13(高山脉) | drawProteins_1.10.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/drawProteins |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ drawProteins |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/drawProteins/ |
包下载报告 | 下载数据 |