命运

DOI:10.18129 / B9.bioc.destiny

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见命运．

创建扩散图

Bioconductor版本:3.12

创建并绘制扩散图。

作者:Philipp Angerer [cre, aut]， Laleh Haghverdi [ctb]， Maren Büttner [ctb]，费比安·泰斯[ctb]， Carsten Marr [ctb]，弗洛里安Büttner [ctb]

维护者:Philipp Angerer < Philipp。在helmholtz-muenchen.de>愤怒

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("destiny")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“命运”)

PDF		Diffusion-Map-recap.pdf
PDF		Diffusion-Maps.pdf
PDF		DPT.pdf
PDF		Gene-Relevance.pdf
PDF		Global-Sigma.pdf
PDF		tidyverse.pdf
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	CellBasedAssays，CellBiology，聚类，软件，可视化
版本	3.4.0
在Bioconductor	BioC 3.2 (R-3.2)(5.5年)
许可证	GPL
取决于	R (>= 3.4.0)
进口	方法，图形，grDevices, utils，统计，矩阵，Rcpp(> = 0.10.3),RcppEigen，RSpectra(0.14 > = 0),irlba，pcaMethods，Biobase，BiocGenerics，SummarizedExperiment，SingleCellExperiment，ggplot2，ggplot.multistats，tidyr，tidyselect，ggthemes，VIM，knn.covertree，代理，RcppHNSW，平滑，尺度，scatterplot3d
链接	Rcpp，RcppEigen, grDevices
建议	nbconvertR(> = 1.3.2),igraph，testthat，模糊神经网络，tidyr
SystemRequirements	c++ 11, jupyter nbconvert(参见nbconvertR的安装文件)
增强了	rgl，SingleCellExperiment
URL	https://theislab.github.io/destiny/https://github.com/theislab/destiny/https://www.helmholtz-muenchen.de/icb/destiny//www.anjoumacpherson.com/packages/destinyhttps://doi.org/10.1093/bioinformatics/btv715
BugReports	https://github.com/theislab/destiny/issues
全靠我
进口我	ctgGEM，CytoTree，flowSpy，phemd
建议我	CellTrails，单片眼镜，嘘
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	destiny_3.4.0.tar.gz
Windows二进制	destiny_3.4.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra)
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/destiny
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/destiny
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/destiny/
软件包下载报告	下载数据